mp3をWavに変換するにはどうしたらいいのでしょうか？

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純粋にwavにするならCDex使うと楽だけど

動画エンコードにwavヘッダ付きMP3を乗せるなら午後のコーダの詳細設定でwav出力に設定すればいいよ。