CDを録音すると、デスクトップに
rec-20100403-1746というファイルが保存されて
それを開くとiTunesが開いて、iTunesのライブラリに
rec-20100403-1746と表記されていて、再生しても曲が再生出来ません。
「ライン入力 MP3録音」タブで右下にある「録音開始」を押せば
CDが録音されるんですよね？
どのプレーヤーで再生しても曲が流れません。

録音時の画面のレベルメーターはどうなっていましたか？
「録音ライン」が違うと、音は聞こえていても無音のみの録音になってしまいます。
「録音デバイス」「ツールのマルチメディアプロパティ」
も見てみることをオススメします。