急に起きるようになったのなら、Windowsのパッチとか周辺機器のドライバとか入れてない?エンコードだけでなく、ベンチマークテストとかで負荷をかけてみたらどうなる?OSのクリーンインストールするとか、いっそ2kにしてしまえば?